IPP Software Navigation Tools IPP Links Communication Pan-STARRS Links

Ignore:
Timestamp:
Jul 30, 2009, 5:20:29 PM (17 years ago)
Author:
watersc1
Message:

Finished up my edits to the detrend cleanup, and some changes to my
copy of burntool and the pslib astrometry. Detrend cleanup has not
been tested yet. That's up next.

Location:
branches/czw_branch/cleanup
Files:
13 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/czw_branch/cleanup

  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/filerules-mef.mdc

    r24698 r24951  
    286286PPNOISEMAP.OUTPUT       OUTPUT {OUTPUT}.{CHIP.NAME}.fits         IMAGE     NONE       CHIP       TRUE      NONE
    287287
    288 CENSOR.OUTPUT           OUTPUT {OUTPUT}.des.smf                  CMF       NONE       FPA        TRUE      MEF
    289 
     288CENSOR.OUTPUT           OUTPUT {OUTPUT}.smf                      CMF       NONE       FPA        TRUE      MEF
     289
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/filerules-simple.mdc

    r24698 r24951  
    232232TRACE.EXP               OUTPUT {OUTPUT}.exp.trace    TEXT      NONE       FPA        TRUE      NONE
    233233
    234 PPNOISEMAP.OUTPUT       OUTPUT {OUTPUT}.{CHIP.NAME}.fits         IMAGE    NONE       CHIP       TRUE      NONE
    235 
    236 CENSOR.OUTPUT           OUTPUT {OUTPUT}.des.smf                  CMF       NONE       FPA        TRUE      MEF
     234PPNOISEMAP.OUTPUT       OUTPUT {OUTPUT}.{CHIP.NAME}.fits IMAGE NONE       CHIP       TRUE      NONE
     235
     236CENSOR.OUTPUT           OUTPUT {OUTPUT}.smf          CMF       NONE       FPA        TRUE      MEF
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/filerules-split.mdc

    r24698 r24951  
    251251PPNOISEMAP.OUTPUT       OUTPUT {OUTPUT}.{CHIP.NAME}.fits         IMAGE     NONE       CHIP       TRUE      NONE
    252252
    253 CENSOR.OUTPUT           OUTPUT {OUTPUT}.des.smf                  CMF       NONE       FPA        TRUE      MEF
     253CENSOR.OUTPUT           OUTPUT {OUTPUT}.smf                      CMF       NONE       FPA        TRUE      MEF
    254254
    255255# {FPA.OBS}
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/ppImage.config

    r24658 r24951  
    1717MASK.LOW           BOOL    TRUE            # Mask pixels below valid range
    1818VARIANCE.BUILD     BOOL    FALSE           # Build internal variance image
     19PATTERN            BOOL    FALSE           # Fit and remove pattern noise?
    1920FRINGE             BOOL    FALSE           # Fringe subtraction
    2021PHOTOM             BOOL    FALSE           # Source identification and photometry
     
    2526USE.DEBURNED.IMAGE BOOL    FALSE           # use burntool-repaired image?
    2627TILTYSTREAK.APPLY  BOOL    FALSE           # apply the 'tiltystreak' tool
     28
    2729
    2830TILTYSTREAK.BY.CLASS METADATA              # apply the 'tiltystreak' tool
     
    7880OVERSCAN.CONSTANT       BOOL    FALSE           # Apply a known, fixed value?
    7981OVERSCAN.VALUE          F32     0.0             # value to apply, if requested
     82
     83# Pattern subtraction options
     84PATTERN.ORDER      S32     2               # Polynomial order
     85PATTERN.ITER       S32     4               # Rejection iterations
     86PATTERN.REJ        F32     2.5             # Rejection threshold
     87PATTERN.THRESH     F32     20.0            # Ignore threshold
     88PATTERN.MEAN       STR     SAMPLE_MEAN     # Statistic for mean
     89PATTERN.STDEV      STR     SAMPLE_STDEV    # Statistic for standard deviation
    8090
    8191# Fringe subtraction options
     
    263273
    264274# Overscan subtraction only
    265 PPIMAGE_O          METADATA
    266   BASE.FITS        BOOL    TRUE            # Save base detrended image?
    267   BASE.MASK.FITS   BOOL    TRUE            # Save base detrended image?
    268   BASE.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
    269   CHIP.FITS        BOOL    FALSE           # Save chip-mosaic-ed image?
    270   CHIP.MASK.FITS   BOOL    FALSE           # Save chip-mosaic-ed image?
    271   CHIP.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save chip-mosaic-ed image?
    272   OVERSCAN         BOOL    TRUE            # Overscan subtraction
    273   BIAS             BOOL    FALSE           # Bias subtraction
    274   DARK             BOOL    FALSE           # Dark subtraction
    275   SHUTTER          BOOL    FALSE           # Shutter correction
    276   FLAT             BOOL    FALSE           # Flat-field normalisation
    277   MASK             BOOL    FALSE           # Mask bad pixels
    278   FRINGE           BOOL    FALSE           # Fringe subtraction
    279   PHOTOM           BOOL    FALSE           # Source identification and photometry
    280   ASTROM.CHIP      BOOL    FALSE           # Astrometry per chip?
    281   ASTROM.MOSAIC    BOOL    FALSE           # Astrometry for mosaic?
    282   BIN1.FITS        BOOL    TRUE            # Save 1st binned chip image?
    283   BIN2.FITS        BOOL    TRUE            # Save 2nd binned chip image?
     275PPIMAGE_O            METADATA
     276  BASE.FITS          BOOL    TRUE            # Save base detrended image?
     277  BASE.MASK.FITS     BOOL    TRUE            # Save base detrended image?
     278  BASE.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     279  CHIP.FITS          BOOL    FALSE           # Save chip-mosaic-ed image?
     280  CHIP.MASK.FITS     BOOL    FALSE           # Save chip-mosaic-ed image?
     281  CHIP.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save chip-mosaic-ed image?
     282  OVERSCAN           BOOL    TRUE            # Overscan subtraction
     283  BIAS               BOOL    FALSE           # Bias subtraction
     284  DARK               BOOL    FALSE           # Dark subtraction
     285  SHUTTER            BOOL    FALSE           # Shutter correction
     286  FLAT               BOOL    FALSE           # Flat-field normalisation
     287  MASK               BOOL    FALSE           # Mask bad pixels
     288  FRINGE             BOOL    FALSE           # Fringe subtraction
     289  PHOTOM             BOOL    FALSE           # Source identification and photometry
     290  ASTROM.CHIP        BOOL    FALSE           # Astrometry per chip?
     291  ASTROM.MOSAIC      BOOL    FALSE           # Astrometry for mosaic?
     292  BIN1.FITS          BOOL    TRUE            # Save 1st binned chip image?
     293  BIN2.FITS          BOOL    TRUE            # Save 2nd binned chip image?
    284294END
    285295
     
    528538    DARK METADATA
    529539      DETTYPE STR DARK_PREMASK
     540      EXPTIME STR FPA.EXPOSURE
     541    END
     542  END   
     543END
     544
     545# Chip processing with DARKTEST
     546CHIP_DARKTEST METADATA
     547  BASE.FITS          BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     548  BASE.MASK.FITS     BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     549  BASE.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     550  CHIP.FITS          BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     551  CHIP.MASK.FITS     BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     552  CHIP.VARIANCE.FITS BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     553  OVERSCAN           BOOL    TRUE            # Overscan subtraction
     554  BIAS               BOOL    TRUE            # Bias subtraction
     555  DARK               BOOL    TRUE            # Dark subtraction
     556  SHUTTER            BOOL    FALSE           # Shutter correction
     557  FLAT               BOOL    TRUE            # Flat-field normalisation
     558  MASK               BOOL    TRUE            # Mask bad pixels
     559  FRINGE             BOOL    TRUE            # Fringe subtraction
     560  BIN1.FITS          BOOL    TRUE            # Save 1st binned chip image?
     561  BIN2.FITS          BOOL    TRUE            # Save 2nd binned chip image?
     562  PHOTOM             BOOL    TRUE            # Source identification and photometry
     563  ASTROM.CHIP        BOOL    FALSE           # Astrometry per chip?
     564  ASTROM.MOSAIC      BOOL    FALSE           # Astrometry for mosaic?
     565  BACKGROUND         BOOL    TRUE            # Subtract background?
     566
     567  DETREND.CONSTRAINTS  METADATA
     568    DARK METADATA
     569      DETTYPE STR DARKTEST
    530570      EXPTIME STR FPA.EXPOSURE
    531571    END
     
    16111651
    16121652#For PR images
    1613 PR      METADATA
    1614 END
     1653PR_DARKTEST_NOSUB       METADATA
     1654  BASE.FITS          BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1655  BASE.MASK.FITS     BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1656  BASE.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1657  CHIP.FITS          BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1658  CHIP.MASK.FITS     BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1659  CHIP.VARIANCE.FITS BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1660  OVERSCAN           BOOL    TRUE            # Overscan subtraction
     1661  BIAS               BOOL    TRUE            # Bias subtraction
     1662  DARK               BOOL    TRUE            # Dark subtraction
     1663  SHUTTER            BOOL    FALSE           # Shutter correction
     1664  FLAT               BOOL    TRUE            # Flat-field normalisation
     1665  MASK               BOOL    TRUE            # Mask bad pixels
     1666  FRINGE             BOOL    TRUE            # Fringe subtraction
     1667  BIN1.FITS          BOOL    TRUE            # Save 1st binned chip image?
     1668  BIN2.FITS          BOOL    TRUE            # Save 2nd binned chip image?
     1669  PHOTOM             BOOL    TRUE            # Source identification and photometry
     1670  ASTROM.CHIP        BOOL    FALSE           # Astrometry per chip?
     1671  ASTROM.MOSAIC      BOOL    FALSE           # Astrometry for mosaic?
     1672  BACKGROUND         BOOL    FALSE            # Subtract background?
     1673
     1674  DETREND.CONSTRAINTS  METADATA
     1675    DARK METADATA
     1676      DETTYPE STR DARKTEST
     1677      EXPTIME STR FPA.EXPOSURE
     1678    END
     1679  END   
     1680END
     1681
     1682PR               METADATA
     1683  BASE.FITS          BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1684  BASE.MASK.FITS     BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1685  BASE.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1686  CHIP.FITS          BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1687  CHIP.MASK.FITS     BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1688  CHIP.VARIANCE.FITS BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1689  OVERSCAN           BOOL    TRUE            # Overscan subtraction
     1690  BIAS               BOOL    TRUE            # Bias subtraction
     1691  DARK               BOOL    TRUE            # Dark subtraction
     1692  SHUTTER            BOOL    FALSE           # Shutter correction
     1693  FLAT               BOOL    TRUE            # Flat-field normalisation
     1694  MASK               BOOL    TRUE            # Mask bad pixels
     1695  FRINGE             BOOL    TRUE            # Fringe subtraction
     1696  BIN1.FITS          BOOL    TRUE            # Save 1st binned chip image?
     1697  BIN2.FITS          BOOL    TRUE            # Save 2nd binned chip image?
     1698  PHOTOM             BOOL    TRUE            # Source identification and photometry
     1699  ASTROM.CHIP        BOOL    FALSE           # Astrometry per chip?
     1700  ASTROM.MOSAIC      BOOL    FALSE           # Astrometry for mosaic?
     1701  BACKGROUND         BOOL    FALSE            # Subtract background?
     1702END
     1703
     1704
     1705# Standard chip processing with pattern subtraction
     1706CHIP_PATTERN    METADATA
     1707  BASE.FITS          BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1708  BASE.MASK.FITS     BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1709  BASE.VARIANCE.FITS BOOL    FALSE           # Save base detrended image?
     1710  CHIP.FITS          BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1711  CHIP.MASK.FITS     BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1712  CHIP.VARIANCE.FITS BOOL    TRUE            # Save chip-mosaic-ed image?
     1713  OVERSCAN           BOOL    TRUE            # Overscan subtraction
     1714  BIAS               BOOL    TRUE            # Bias subtraction
     1715  DARK               BOOL    TRUE            # Dark subtraction
     1716  SHUTTER            BOOL    FALSE           # Shutter correction
     1717  FLAT               BOOL    TRUE            # Flat-field normalisation
     1718  MASK               BOOL    TRUE            # Mask bad pixels
     1719  PATTERN            BOOL    TRUE            # Subtract pattern noise?
     1720  FRINGE             BOOL    TRUE            # Fringe subtraction
     1721  BIN1.FITS          BOOL    TRUE            # Save 1st binned chip image?
     1722  BIN2.FITS          BOOL    TRUE            # Save 2nd binned chip image?
     1723  PHOTOM             BOOL    TRUE            # Source identification and photometry
     1724  ASTROM.CHIP        BOOL    FALSE           # Astrometry per chip?
     1725  ASTROM.MOSAIC      BOOL    FALSE           # Astrometry for mosaic?
     1726  BACKGROUND         BOOL    TRUE            # Subtract background?
     1727END
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/ppMerge.config

    r24129 r24951  
    1010NKEEP               S32     5               # Minimum number of pixels in stack to keep
    1111VARIANCES           BOOL    FALSE           # Use image variances in combination?
     12
    1213FRINGE.NUM          S32     10000           # Number of fringe regions
    1314FRINGE.SIZE         S32     5               # Half-size of fringe regions
    1415FRINGE.XSMOOTH      S32     5               # Number of smoothing regions in x
    1516FRINGE.YSMOOTH      S32     11              # Number of smoothing regions in y
     17FRINGE.SMOOTH       BOOL    FALSE           # Smooth the output image?
     18FRINGE.SMOOTH.SIGMA F32     2.0             # Sigma of smoothing Gaussian
     19
    1620CTE.MIN             F32     0.5             # regions lower than this in the CTE image are masked
    1721SHUTTER.SIZE        S32     128             # Size for shutter measurement regions
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/ppSim.config

    r24099 r24951  
    1313BIAS.ORDER      S32     7               # Order for overscan polynomial
    1414
     15# dark signal = (DARK.RATE + DARK.TEMP1*TEMP + DARK.TEMP2*TEMP^2)*EXPTIME
    1516DARK            BOOL    TRUE
    1617DARK.RATE       F32     5.0             # Dark current (e/s)
     18DARK.TEMP       F32     0.0             # Dark temperature trend (e/s/C)
     19DARK.TEMP2      F32     0.0             # 2nd order Dark temperature trend (e/s/C^2)
     20DET.TEMP        F32   -20.0             # Detector temperature
     21
     22# dark signal = (DARK.RATE + DARK.TEMP1*TEMP + DARK.TEMP2*TEMP^2)*EXPTIME
     23# the following dark model can be used to test ppMerge with DARK.ORDINATES
     24TEST.DARKTEMP   METADATA
     25  DARK            BOOL    TRUE
     26  DARK.RATE     F32     25.0            # Dark current (e/s)
     27  DARK.TEMP     F32     0.5             # Dark temperature trend (e/s/C)
     28  DARK.TEMP2    F32     0.05            # 2nd order Dark temperature trend (e/s/C^2)
     29  DET.TEMP      F32     -20.0           # Detector temperature
     30END
    1731
    1832FLAT            BOOL    TRUE
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/ppStack.config

    r24511 r24951  
    1919BIN1            S32     4               # Binning factor for first level
    2020BIN2            S32     4               # Binning factor for second level
     21SKIP.BG.SUB     BOOL    FALSE           # Bypass background subtraction?
    2122
    2223RENORM          BOOL    FALSE           # Renormalise variance maps?
     
    7980        CONVOLVE        BOOL    FALSE
    8081        IMAGE.REJ       F32     0.5     
     82        SKIP.BG.SUB     BOOL    FALSE
    8183END
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/ppStats.config

    r23824 r24951  
    221221  CONCEPT       STR     FPA.CAMERA      # Instrument (eg, CFH12K)
    222222  CONCEPT       STR     CHIP.TEMP       # Detector temperature
     223  CONCEPT       STR     FPA.TEMP        # Camera temperature
    223224END
    224225
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/ppSub.config

    r24673 r24951  
    1818MASK.POOR       STR     CONV.POOR       # Mask value to give poor pixels
    1919
     20LOW.THRESHOLD   F32     4.0             # Mask pixels below this threshold (std dev)
    2021POOR.FRACTION   F32     0.10            # Maximum fraction of bad weight for poor pixels
    2122BADFRAC         F32     0.95            # Maximum fraction of bad pixels
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/psphot.config

    r24593 r24951  
    216216FOOTPRINT_CULL_NSIGMA_DELTA         F32   4               # Cull peaks that aren't nsigma above coll to neighbour
    217217FOOTPRINT_CULL_NSIGMA_MIN           F32   1               # Minimum height of colls in units of skyStdev
     218FOOTPRINT_CULL_NSIGMA_PAD           F32   0.01            # Fractional Padding for stdev
    218219
    219220# alternate PSPHOT-type recipes
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/reductionClasses.mdc

    r24704 r24951  
    1616        DARK_PREMASK_JPEG_RESID STR     BIAS_RESID
    1717
     18        DARKTEST_PROCESS        STR     PPIMAGE_OB
     19        DARKTEST_RESID          STR     PPIMAGE_D
     20        DARKTEST_VERIFY         STR     PPIMAGE_D
     21        DARKTEST_STACK          STR     PPMERGE_DARK
     22        DARKTEST_JPEG_IMAGE     STR     BIAS
     23        DARKTEST_JPEG_RESID     STR     BIAS_RESID
     24
    1825        DARK_PROCESS            STR     PPIMAGE_OB
    1926        DARK_RESID              STR     PPIMAGE_D
     
    298305# Intended for fast processing to make PR images
    299306PR              METADATA
    300         CHIP_PPIMAGE    STR     CHIP
     307        CHIP_PPIMAGE    STR     PR
    301308        CHIP_PSPHOT     STR     PR
    302309        WARP_PSWARP     STR     WARP
     
    312319        PSASTRO         STR     PR_RECIPE
    313320END
     321
     322# Intended for fast processing to make PR images
     323PR_DARKTEST     METADATA
     324        CHIP_PPIMAGE    STR     PR_DARKTEST_NOSUB
     325        CHIP_PSPHOT     STR     PR
     326        WARP_PSWARP     STR     WARP
     327        STACK_PPSTACK   STR     PR
     328        STACK_PPSUB     STR     PR
     329        STACK_PSPHOT    STR     PR
     330        DIFF_PPSUB      STR     DIFF
     331        DIFF_PSPHOT     STR     DIFF
     332        JPEG_BIN1       STR     PPIMAGE_J1
     333        JPEG_BIN2       STR     PPIMAGE_J2
     334        FAKEPHOT        STR     FAKEPHOT
     335        ADDSTAR         STR     ADDSTAR
     336        PSASTRO         STR     PR_RECIPE
     337END
     338
     339# Testing pattern subtraction
     340TEST_PATTERN    METADATA
     341        CHIP_PPIMAGE    STR     CHIP_PATTERN
     342        CHIP_PSPHOT     STR     CHIP
     343        WARP_PSWARP     STR     WARP
     344        STACK_PPSTACK   STR     STACK
     345        STACK_PPSUB     STR     STACK
     346        STACK_PSPHOT    STR     STACK
     347        DIFF_PPSUB      STR     DIFF
     348        DIFF_PSPHOT     STR     DIFF
     349        JPEG_BIN1       STR     PPIMAGE_J1
     350        JPEG_BIN2       STR     PPIMAGE_J2
     351        FAKEPHOT        STR     FAKEPHOT
     352        ADDSTAR         STR     ADDSTAR
     353        PSASTRO         STR     DEFAULT_RECIPE
     354END
  • branches/czw_branch/cleanup/ippconfig/recipes/rejections.config

    r23473 r24951  
     1# these names (BIAS, DARK, etc) must be upper case
    12
    23BIAS METADATA
     
    4950
    5051DARK_PREMASK METADATA
     52  FILTER             STR  *
     53  EXPECTED           F32  0.0
     54  IMFILE.MEAN        F32  0.0
     55  IMFILE.STDEV       F32  0.0
     56  IMFILE.MEANSTDEV   F32  0.0
     57  IMFILE.SKEWNESS    F32  0.0
     58  IMFILE.KURTOSIS    F32  0.0
     59  IMFILE.SNR         F32  0.0
     60  IMFILE.BIN.STDEV   F32  0.0
     61  IMFILE.BIN.SNR     F32  0.0
     62  IMFILE.FLUX        F32  0.0
     63  EXP.MEAN           F32  0.0
     64  EXP.STDEV          F32  0.0
     65  EXP.MEANSTDEV      F32  0.0
     66  EXP.SNR            F32  0.0
     67  EXP.BIN.STDEV      F32  0.0
     68  EXP.BIN.SNR        F32  0.0
     69  EXP.FLUX           F32  0.0
     70  ENSEMBLE.MEAN      F32  0.0
     71  ENSEMBLE.STDEV     F32  0.0
     72  ENSEMBLE.MEANSTDEV F32  0.0
     73END
     74
     75DARKTEST METADATA
    5176  FILTER             STR  *
    5277  EXPECTED           F32  0.0
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.