IPP Software Navigation Tools IPP Links Communication Pan-STARRS Links

Ignore:
Timestamp:
Mar 28, 2015, 8:28:32 PM (11 years ago)
Author:
eugene
Message:

merge changes from trunk

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/eam_branches/ipp-20150112/ippToPsps/jython/forcedwarpbatch.py

    r37592 r38052  
    66import time
    77import stilts
     8import re
    89
    910from java.lang import *
    … …  
    5455               forcedWarpID,
    5556               batchID,
    56                "P2",
    57                gpc1Db.getForcedWarpStageSmf(forcedWarpID)
    58 
     57               "FW",
     58               None)
     59     #          gpc1Db.getForcedWarpStageSmf(forcedWarpID)
     60       # there is a funny problem with order here: we need to open the file first to read the header to get
     61       # to skycell ID
     62       #forcedWarpID = self.forcedWarpID       
     63       self.logger.infoPair("getting the fits file for add_id",forcedWarpID)
     64       self.fits = gpc1Db.getForcedWarpStageCmf(skychunk.dvoLabel, forcedWarpID)
     65       self.forcedWarpID = forcedWarpID
     66       self.header = self.fits.getPrimaryHeader()
     67       self.warpSkyFileID = self.getKeyValue(self.header,"IMAGEID")
     68       self.filterName = self.getKeyValue(self.header,"FPA.FILTERID")
     69       self.logger.infoPair("found filterName",self.filterName)
     70       self.logger.infoPair("found warp_skyfile_id",self.warpSkyFileID)
    5971       # get camera meta data
    60        meta = self.gpc1Db.getForcedWarpStageMeta(self.id)
     72
     73       meta = self.gpc1Db.getForcedWarpStageMeta(forcedWarpID, self.warpSkyFileID)
     74
    6175       if not meta:
    6276           self.logger.errorPair("Could not get", "forced warp metadata")
    6377           raise
    6478
    65        self.expID = meta[0];
    66        self.expName = meta[1];
    67        self.distGroup = meta[2];
    68        self.analysisVer = meta[3];
    69        self.bias = meta[4];
    70        self.biasScat = meta[5];
     79       self.expID = meta[0]
     80       self.expTime = meta[1]
     81       self.analysisVer = meta[2]
     82       self.skycellName = meta[3]
     83       self.tessName = meta[4]
     84       
     85       self.logger.infoPair("found exp_id",str(self.expID))
     86       self.logger.infoPair("found exp_time",str(self.expTime))
     87       self.logger.infoPair("found skycell_id",self.skycellName)
     88       self.logger.infoPair("found tess_id",self.tessName)
     89
     90
     91       #tessName = self.getKeyValue(self.header, 'TESS_ID')
     92       #self.tessID = self.scratchDb.getTessID(tessName)
    7193
    7294       if not self.analysisVer: self.analysisVer = -999
     95       if self.analysisVer is None: self.analysisVer = "-999"
     96       self.logger.infoPair("found analysisVer",self.analysisVer)
     97
     98       if self.tessName == 'RINGS.V3':
     99
     100           # skycell is, eg "skycell.1133.081"
     101           #                 0123456789012345
     102           self.projectionID = self.skycellName[8:12]
     103           #self.skycellID = self.skycellName[13:]
     104           self.skycellID = self.skycellName[8:]
     105       else:
     106           # skycell is, eg "skycell.081"
     107           #                 01234567890
     108           self.projectionID = 0
     109           self.skycellID = self.skycellName[8:11]
     110           self.skycellID=self.skycellName[8:]
     111       if self.skycellID == "":
     112           self.skycellID = -1
     113
     114       self.logger.infoPair("projection cell found ",self.projectionID)
     115       self.logger.infoPair("skycell found", self.skycellID)
     116
     117
    73118
    74119       # create an output filename, which is {expID}.FITS
    75        self.outputFitsFile = "%08d.FITS" % self.expID
     120       self.outputFitsFile = "%08d.FITS" % forcedWarpID
    76121       self.outputFitsPath = "%s/%s" % (self.localOutPath, self.outputFitsFile)
    77122       self.dropTableVerbose("ForcedWarpMeasurement")
    … …  
    79124       self.dropTableVerbose("ForcedWarpMeta")
    80125       self.dropTableVerbose("ForcedWarpToImage")
     126       self.dropTableVerbose("ForcedWarpLensing")
    81127       if not self.config.retry:
    82        self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpMeasurement")
    83        self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpExtended")
    84        self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpMeta")
    85        self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpToImage")
     128           self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpMeasurement")
     129           self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpExtended")
     130           self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpMeta")
     131           self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpToImage")
     132           self.scratchDb.dropTable("ForcedWarpLensing")
    86133       self.historyModNum = "0"
    87134
    88135       # get a few primary header values. if in test mode, then use defaults
    89        if self.safeDictionaryAccessWithDefault(self.header, 'MJD-OBS', "1") == "NULL":
    90            self.logger.errorPair("Could not get", "MJD-OBS")
    91            raise
    92 
    93 
    94        if self.safeDictionaryAccessWithDefault(self.header, 'EXPTIME', "1") == "NULL":
    95            self.logger.errorPair("Could not get", "EXPTIME")
    96            raise
    97 
    98        if self.safeDictionaryAccessWithDefault(self.header, 'FILTERID', "g.0000") == "NULL":
    99            self.logger.errorPair("Could not get", "FILTERID")
    100            raise
    101        
     136       self.logger.infoPair("calculating ObsTime","ok")
    102137       # MJD-OBS is the exposure start, EXTIME / 172800 = (EXPTIME sec / 84600 sec/day) / 2
    103        self.obsTime = float(self.header['MJD-OBS']) + (float(self.header['EXPTIME']) / 172800.0)
    104      
     138       self.obsTime = float(self.header['MJD-OBS']) + (float(self.expTime) / 172800.0)
     139       self.logger.infoPair("obstime",self.obsTime)
    105140       # set up some defauts
    106141       self.calibModNum = 0
    107142       self.totalNumPhotoRef = 0
    108143
    109 
    110        self.filter = self.header['FILTERID'][0:1]
    111        self.filterID = self.scratchDb.getFilterID(self.filter)
     144       self.filterID = self.scratchDb.getFilterID(self.filterName[0])
     145       self.logger.infoPair("filterID is ",self.filterID)
    112146
    113147       # insert what we know about this stack batch into the stack table
    114        self.ippToPspsDb.insertDetectionMeta(self.batchID, self.expID, self.filter)
     148       self.logger.infoPair("inserting basics into ","ForcedWarpMeta")
     149
     150       self.ippToPspsDb.insertForcedWarpMeta(int(self.batchID), int(self.expID), self.filterName[0])
    115151
    116152       # dump stuff to log
    117        self.logger.infoPair("Cam ID", "%d" % self.id)
    118        self.logger.infoPair("Exp ID", "%d" % self.expID)
    119        self.logger.infoPair("Exp name", "%s" % self.expName)
    120        self.logger.infoPair("Distribution group", "%s" % self.distGroup)
     153       self.logger.infoPair("add ID", "%d" % self.id)
     154       self.logger.infoPair("Exp ID", self.expID)
     155
     156
    121157
    122158
    … …  
    129165        self.logger.infoPair("Processing table", "ForcedWarpMeta")
    130166
    131         photoCalID = str(self.scratchDb.getPhotoCalID(forcedWarpID))       
    132 
     167        header   = self.header
     168#        photoCalID = str(self.scratchDb.getPhotoCalID(forcedWarpID))       
    133169
    134170        sqlLine = sqlUtility("INSERT INTO ForcedWarpMeta (")
    … …  
    136172        #surveyID (below)
    137173        #filterdID (below)
     174        sqlLine.group("forcedWarpID", str(self.forcedWarpID))
    138175        sqlLine.group("skyCellID",     str(self.skycellID))
    139         sqlLine.group("photoCalID",    photoCalID)
     176#        sqlLine.group("photoCalID",    photoCalID)
    140177        sqlLine.group("magSat",           self.getKeyFloat(header, "%.8f", 'FSATUR'))
    141         sqlLine.group("analVer",           self.analysisVer);
    142         sqlLine.group("expTime",               self.getKeyFloat(self.header, "%.8f", 'EXPREQ'));
     178        sqlLine.group("analVer",           str(self.analysisVer))
     179        sqlLine.group("expTime",self.expTime)
    143180        sqlLine.group("completMag",       self.getKeyFloat(header, "%.8f", 'FLIMIT'))
    144         sqlLine.group("astroScat",        self.getKeyFloat(header, "%.8f", 'CERROR'))
    145         sqlLine.group("photoScat",             self.getKeyFloat(self.header, "%.8f", 'ZPT_ERR'));
    146         sqlLine.group("nAstroRef",      self.getKeyValue(header, 'NASTRO'))
    147         sqlLine.group("nPhotoRef",      self.getKeyValue(header, 'NASTRO'))
     181#        sqlLine.group("astroScat",        self.getKeyFloat(header, "%.8f", 'CERROR'))
     182#        sqlLine.group("photoScat",             self.getKeyFloat(self.header, "%.8f", 'ZPT_ERR'));
     183#no nastro
     184#        sqlLine.group("nAstroRef",      self.getKeyValue(header, 'NASTRO'))
     185#        sqlLine.group("nPhotoRef",      self.getKeyValue(header, 'NASTRO'))
    148186        sqlLine.group("psfModelID",     self.getKeyValue(header, 'PSFMODEL'))
    149187        sqlLine.group("psfFwhm_mean",   self.getKeyFloat(header, "%.8f", 'FWHM_MAJ'))
    150188        sqlLine.group("psfFwhm_max",    self.getKeyFloat(header, "%.8f", 'FW_MJ_UQ'))
    151         sqlLine.group("photoZero",        self.getKeyFloat(self.header, "%.8f", 'ZPT_OBS'))
     189#        sqlLine.group("photoZero",        self.getKeyFloat(self.header, "%.8f", 'ZPT_OBS'))
    152190        #photoColor -- how do I set this? it's also not set in stack meta
    153191        sqlLine.group("ctype1",                self.getKeyValue(self.header, 'CTYPE1'));
    … …  
    174212        self.scratchDb.updateAllRows("ForcedWarpMeta", "batchID", str(self.batchID))
    175213        self.scratchDb.updateAllRows("ForcedWarpMeta", "surveyID", str(self.surveyID))
    176         self.scratchDb.updateFilterID("ForcedWarpMeta", self.filter)
     214#        self.scratchDb.updateFilterID("ForcedWarpMeta", self.filterID)
     215        self.scratchDb.updateFilterID("ForcedWarpMeta",self.filterName[0])
    177216        self.scratchDb.updateAllRows("ForcedWarpMeta", "calibModNum", str(self.calibModNum))
    178217        self.scratchDb.updateAllRows("ForcedWarpMeta", "dataRelease", str(self.skychunk.dataRelease))
    179         self.tablesToExport.append("ForcedWarpMeta")
     218        #self.tablesToExport.append("ForcedWarpMeta")
    180219       
    181220    '''
    … …  
    186225        self.logger.infoPair("Procesing table", "ForcedWarpToImage")
    187226
    188         for filter in self.filters:
    189            
    190             forcedwarpID = self.forcedwarpID
    191             if forcedwarpID > 0:
     227        forcedwarpID = self.forcedWarpID
     228        if forcedwarpID > 0:
    192229   
    193230                imageIDs = self.gpc1Db.getImageIDsForThisForcedWarpID(forcedwarpID)
    … …  
    198235                   VALUES (\
    199236                   " + str(forcedwarpID) + ", " + imageID + ")"
    200                     self.scratchDb.execute(sql)
    201 
     237                    try: self.scratchDb.execute(sql)
     238                    except:
     239                       self.logger.infoPair("can't execute sql",sql)
     240                       raise
    202241                    # now update StackMeta with correct number of inputs
    203242
    204         self.tablesToExport.append("ForcedWarpToImage")
     243        #self.tablesToExport.append("ForcedWarpToImage")
    205244
    206245
    … …  
    211250    Populates the ForcedWarpMeasurement table
    212251    '''
    213     def populateForcedWarpMeasurementTable(self, results):
     252    def populateForcedWarpMeasurement(self):
    214253
    215254        pspsTableName = "ForcedWarpMeasurement"
    216         ippTableName = "ForcedWarpMeasurement_psf"
     255        ippTableName = "SkyChip_psf"
    217256
    218257
    219258        self.logger.infoPair("Procesing table", "ForcedWarpMeasurement")
    220259
     260        BEFORE = self.scratchDb.getRowCount(ippTableName)
     261        extTimeString = str(self.expTime)
     262
     263#missing are zp, telluricExt, airmass (not easy to get ?)
     264
     265        sqlLine = sqlUtility("INSERT INTO " + pspsTableName + " (")
     266        sqlLine.group("ippDetectID",     "IPP_IDET")
     267        sqlLine.group("forcedWarpID",            str(self.forcedWarpID));
     268        sqlLine.group("randomWarpID",     "FLOOR(RAND("+str(self.batchID)+")*9223372036854775807)")   
     269        sqlLine.group("filterID",        str(self.filterID))
     270        sqlLine.group("surveyID",        str(self.surveyID))
     271        sqlLine.group("skycellID",       str(self.skycellID))
     272        sqlLine.group("expTime",         str(self.expTime))
     273        sqlLine.group("obsTime", str(self.obsTime))
     274        sqlLine.group("psfFlux", "PSF_INST_FLUX / "+extTimeString)
     275        sqlLine.group("psfFluxErr", "PSF_INST_FLUX_SIG / "+extTimeString)
     276        sqlLine.group("psfMajorFWHM",    "PSF_FWHM_MAJ")
     277        sqlLine.group("psfMinorFWHM",    "PSF_FWHM_MIN")
     278        sqlLine.group("psfTheta",        "PSF_THETA")
     279        sqlLine.group("psfCore",         "PSF_CORE")
     280        sqlLine.group("psfQf",           "PSF_QF")
     281        sqlLine.group("psfQfPerfect",    "PSF_QF_PERFECT")
     282        sqlLine.group("psfChiSq",        "PSF_CHISQ")
     283        sqlLine.group("psfLikelihood",   "psfLikelihood(EXT_NSIGMA)")
     284        sqlLine.group("momentXX",        "MOMENTS_XX")
     285        sqlLine.group("momentXY",        "MOMENTS_XY")
     286        sqlLine.group("momentYY",        "MOMENTS_YY")
     287        sqlLine.group("momentR1",        "MOMENTS_R1")
     288        sqlLine.group("momentRH",        "MOMENTS_RH")
     289        sqlLine.group("momentM3C",       "MOMENTS_M3C")
     290        sqlLine.group("momentM3S",       "MOMENTS_M3S")
     291        sqlLine.group("momentM4C",       "MOMENTS_M4C")
     292        sqlLine.group("momentM4S",       "MOMENTS_M4S")
     293        sqlLine.group("apFlux","AP_FLUX / " + extTimeString)
     294        sqlLine.group("apFluxErr","AP_FLUX_SIG / " + extTimeString)
     295        sqlLine.group("apFillF","AP_NPIX / (3.14159265359 * POW(AP_MAG_RADIUS - 0.5, 2))")
     296        sqlLine.group("kronFlux","KRON_FLUX / " + extTimeString)
     297        sqlLine.group("kronFluxErr","KRON_FLUX_ERR / " + extTimeString )
     298        sqlLine.group("kronRad","MOMENTS_R1 * 2.5")
     299        sqlLine.group("sky","SKY /" +extTimeString)
     300        sqlLine.group("skyErr","SKY_SIGMA / "+extTimeString)
     301        sqlLine.group("infoFlag","FLAGS")
     302        sqlLine.group("infoFlag2","FLAGS2")
     303        sqlLine.group("dataRelease",str(self.skychunk.dataRelease))
     304
     305        sql = sqlLine.makeRaw(") SELECT ", " FROM " + ippTableName)
     306
     307        try: self.scratchDb.execute(sql)
     308        except:
     309            self.logger.errorPair("failed sql: ", sql)
     310            raise
     311
     312
     313
     314
    221315        # insert the per-object data (IDs, random stack ID, dataRelease, etc)
    222         self.selectDvoObjIDs()
    223 
    224         self.generateRandomIDs()
    225 
     316        #self.selectDvoObjIDs()
     317        self.logger.infoPair("inserting dvo info: find imageID","from externID")
     318        imageID = self.scratchDb.getImageIDFromExternID(self.warpSkyFileID)
     319        self.logger.infoPair("updating","forcedWarpMeasurement")
     320        sqlLine = sqlUtility("UPDATE ForcedWarpMeasurement as a, " + self.scratchDb.dvoDetectionTable + " as b SET ")
     321        sqlLine.group("a.objID","b.objID")
     322        sqlLine.group("a.detectID","b.detectID")
     323        sqlLine.group("a.ippObjID","b.ippObjID")
     324        sqlLine.group("a.dvoRegionID","b.catID")
     325        sqlLine.group("a.zp","b.zp")
     326        sqlLine.group("a.telluricExt","b.telluricExt")
     327        sqlLine.group("a.airmass","b.airmass")
     328        sql = sqlLine.makeEquals("WHERE a.ippDetectID = b.ippDetectID AND b.imageID = " +str( imageID))
     329        try: self.scratchDb.execute(sql)
     330        except:
     331            self.logger.errorPair("failed sql:",sql)
     332            raise
     333        self.logger.infoPair("need to cull"," nulls objid")
     334        results= self.scratchDb.reportAndDeleteRowsWithNULLS("ForcedWarpMeasurement", "objID")
     335
     336
     337
     338#        self.generateRandomIDs()
     339
     340        self.logger.infoPair("Adding 'row' columns to", "ForcedWarpMeasurement")
     341        self.scratchDb.addRowCountColumn("ForcedWarpMeasurement", "row")
     342        self.logger.infoPair("Adding unique ids to", "ForcedWarpMeasurement")
    226343        self.generateUniquePspsIDs()
     344        self.logger.infoPair("Dropping row column from", "ForcedWarpMeasurement table")
     345        self.scratchDb.dropColumn("ForcedWarpMeasurement", "row")
    227346           
    228347        # add indexes ForcedWarpMeasurement
    229348        self.scratchDb.createIndex("ForcedWarpMeasurement", "objID")
    230 
     349        self.scratchDb.createIndex("ForcedWarpMeasurement", "ippDetectID")
     350    '''
     351    Populates the ForcedWarpExtended table
     352    '''
     353    def populateForcedWarpExtended(self):
     354
     355        pspsTableName = "ForcedWarpExtended"
     356        ippTableName = "SkyChip_xrad"
     357
     358        #self.tablesToExport.append("ForcedWarpExtended")
     359
     360        #isert stuff from SkyChip_psf
     361        sqlLine = sqlUtility("INSERT INTO " + pspsTableName + " (")
     362        sqlLine.group("ippDetectID",     "IPP_IDET")
     363        sqlLine.group("flxR5", "APER_FLUX_5")
     364        sqlLine.group("flxR5Err", "APER_FLUX_ERR_5" )
     365        sqlLine.group("flxR5Std", "APER_FLUX_STDEV_5")
     366        sqlLine.group("flxR5Fill", "APER_FILL_5")
     367        sqlLine.group("flxR6", "APER_FLUX_6")
     368        sqlLine.group("flxR6Err", "APER_FLUX_ERR_6" )
     369        sqlLine.group("flxR6Std", "APER_FLUX_STDEV_6")
     370        sqlLine.group("flxR6Fill", "APER_FILL_6")
     371
     372        sql = sqlLine.makeRaw(") SELECT ", " FROM " + ippTableName)
     373
     374        try: self.scratchDb.execute(sql)
     375        except:
     376            self.logger.errorPair("failed sql: ", sql)
     377            raise
     378
     379        #insert the things from FOrcedWarpMeasurement
     380        self.logger.infoPair("inserting objID,etc from","ForcedWarpMeasurement")
     381        sqlLine = sqlUtility("UPDATE " + pspsTableName + " as a, ForcedWarpMeasurement as b SET ")
     382        sqlLine.group("a.objID","b.objID")
     383        sqlLine.group("a.uniquePspsFWid","b.uniquePspsFWid")
     384        sqlLine.group("a.detectID","b.detectID")
     385        sqlLine.group("a.ippObjID","b.ippObjID")
     386        sqlLine.group("a.filterID","b.filterID")
     387        sqlLine.group("a.surveyID","b.surveyID")
     388        sqlLine.group("a.forcedWarpID","b.forcedWarpID")
     389        sqlLine.group("a.randomWarpID","b.randomWarpID")
     390        sqlLine.group("a.skycellID","b.skycellID")
     391        sqlLine.group("a.dvoRegionID","b.dvoRegionID")
     392        sqlLine.group("a.obsTime","b.obsTime")
     393        sql = sqlLine.makeEquals("Where a.ippDetectID = b.ippDetectID")
     394        try: self.scratchDb.execute(sql)
     395        except:
     396            self.logger.errorPair("failed sql: ", sql)
     397            raise
     398       
     399       # add in the psps unique ids from stuff
     400        self.logger.infoPair("adding information from Skychip_xrad into","ForcedWarpExtended")
     401       
     402        # cull bad d
     403        self.logger.infoPair("need to cull"," nulls objid")
     404        results= self.scratchDb.reportAndDeleteRowsWithNULLS("ForcedWarpExtended", "objID")
     405       
     406        self.scratchDb.createIndex("ForcedWarpExtended", "objID")
    231407               
    232408
    233409
    234 
    235 
    236 
    237 
    238 
    239         self.tablesToExport.append("ForcedWarpMeasurement")
    240 
    241 
    242     '''
    243     Populates the ForcedWarpExtended table
    244     '''
    245     def populateForcedWarpExtendedTable(self, results):
    246 
    247         pspsTableName = "ForcedWarpExtended"
    248         ippTableName = "ForcedWarpExtended_psf"
    249 
    250    
    251         self.tablesToExport.append("ForcedWarpExtended")
    252 
    253            # get dvo ids,
    254         # add in the psps unique ids from stuff
     410    '''                                                                                                                                                                 
     411    Populates the ForcedWarpExtended table                                                                                                                               
     412    '''
     413    def populateForcedWarpLensing(self):
     414
     415        pspsTableName = "ForcedWarpLensing"
     416        ippTableName = "SkyChip_psf"
     417
     418        #self.tablesToExport.append("ForcedWarpExtended")                                                                                                               
     419
     420        #isert stuff from SkyChip_psf                                                                                                                                   
     421        sqlLine = sqlUtility("INSERT INTO " + pspsTableName + " (")
     422        sqlLine.group("ippDetectID",     "IPP_IDET")
     423        sqlLine.group("lensObjSmearX11", "LENS_X11_SM_OBJ")
     424        sqlLine.group("lensObjSmearX12", "LENS_X12_SM_OBJ")
     425        sqlLine.group("lensObjSmearX22", "LENS_X22_SM_OBJ")
     426        sqlLine.group("lensObjSmearE1", "LENS_E1_SM_OBJ")
     427        sqlLine.group("lensObjSmearE2", "LENS_E2_SM_OBJ")
     428        sqlLine.group("lensObjShearX11", "LENS_X11_SH_OBJ")
     429        sqlLine.group("lensObjShearX12", "LENS_X12_SH_OBJ")
     430        sqlLine.group("lensObjShearX22", "LENS_X22_SH_OBJ")
     431        sqlLine.group("lensObjShearE1", "LENS_E1_SH_OBJ")
     432        sqlLine.group("lensObjShearE2", "LENS_E2_SH_OBJ")
     433        sqlLine.group("lensPSFSmearX11", "LENS_X11_SM_PSF")
     434        sqlLine.group("lensPSFSmearX12", "LENS_X12_SM_PSF")
     435        sqlLine.group("lensPSFSmearX22", "LENS_X22_SM_PSF")
     436        sqlLine.group("lensPSFSmearE1", "LENS_E1_SM_PSF")
     437        sqlLine.group("lensPSFSmearE2", "LENS_E2_SM_PSF")
     438        sqlLine.group("lensPSFShearX11", "LENS_X11_SH_PSF")
     439        sqlLine.group("lensPSFShearX12", "LENS_X12_SH_PSF")
     440        sqlLine.group("lensPSFShearX22", "LENS_X22_SH_PSF")
     441        sqlLine.group("lensPSFShearE1", "LENS_E1_SH_PSF")
     442        sqlLine.group("lensPSFShearE2", "LENS_E2_SH_PSF")
     443        sql = sqlLine.makeRaw(") SELECT ", " FROM " + ippTableName)
     444
     445        try: self.scratchDb.execute(sql)
     446        except:
     447            self.logger.errorPair("failed sql: ", sql)
     448            raise
     449
     450        #insert the things from FOrcedWarpMeasurement                                                                                                                   
     451        self.logger.infoPair("inserting objID,etc from","ForcedWarpMeasurement")
     452        sqlLine = sqlUtility("UPDATE " + pspsTableName + " as a, ForcedWarpMeasurement as b SET ")
     453        sqlLine.group("a.objID","b.objID")
     454        sqlLine.group("a.uniquePspsFWid","b.uniquePspsFWid")
     455        sqlLine.group("a.detectID","b.detectID")
     456        sqlLine.group("a.ippObjID","b.ippObjID")
     457        sqlLine.group("a.filterID","b.filterID")
     458        sqlLine.group("a.surveyID","b.surveyID")
     459        sqlLine.group("a.forcedWarpID","b.forcedWarpID")
     460        sqlLine.group("a.randomWarpID","b.randomWarpID")
     461        sqlLine.group("a.skycellID","b.skycellID")
     462        sqlLine.group("a.dvoRegionID","b.dvoRegionID")
     463        sqlLine.group("a.obsTime","b.obsTime")
     464        sql = sqlLine.makeEquals("Where a.ippDetectID = b.ippDetectID")
     465        try: self.scratchDb.execute(sql)
     466        except:
     467            self.logger.errorPair("failed sql: ", sql)
     468            raise
     469
     470       # add in the psps unique ids from stuff                                                                                                                           
     471        self.logger.infoPair("adding information from Skychip_psf into","ForcedWarpLensing")
     472
     473        # cull bad d                                                                                                                                                     
     474        self.logger.infoPair("need to cull"," nulls objid")
     475        results= self.scratchDb.reportAndDeleteRowsWithNULLS("ForcedWarpLensing", "objID")
     476
     477        self.scratchDb.createIndex("ForcedWarpLensing", "objID")
     478
     479
    255480
    256481    '''
    … …  
    264489   
    265490        #this should be done
     491        self.logger.infoPair("Populating","ForcedWarpMeta")
    266492        self.populateForcedWarpMeta()         
    267 
    268         self.populateForcedWarpMeasurement()           
     493        self.tablesToExport.append("ForcedWarpMeta")
     494
     495        self.logger.infoPair("Populating","ForcedWarpMeasurement")
     496        self.populateForcedWarpMeasurement()         
     497        self.tablesToExport.append("ForcedWarpMeasurement")
     498
     499        self.logger.infoPair("Populating","ForcedWarpExtended")
    269500        self.populateForcedWarpExtended()
     501        self.tablesToExport.append("ForcedWarpExtended")
     502
     503        self.logger.infoPair("Populating","ForcedWarpLensing")
     504        self.populateForcedWarpLensing()
     505        self.tablesToExport.append("ForcedWarpLensing")
     506
     507
     508        self.logger.infoPair("Populating","ForcedWarpToImage")
    270509        self.populateForcedWarpToImage()
    271              
     510        self.tablesToExport.append("ForcedWarpToImage")             
     511
     512
     513        self.logger.infoPair("setting min/max objid from","ForcedWarpMeasurement")
    272514        self.setMinMaxObjID(["ForcedWarpMeasurement"])
    273515
    … …  
    281523    '''
    282524    def importIppTables(self, columns="*", tableRE=""):
    283        
     525        count = 0
    284526        if self.config.retry: return True
    285527        self.logger.infoPair("Importing FW tables with table match expression: ", tableRE)
    … …  
    302544           
    303545           # drop any previous tables before import
     546           
    304547           self.scratchDb.dropTable(table.name)
    305548                 
    … …  
    318561        self.logger.infoPair("Done. Imported", "%d tables" % count)
    319562        self.indexIppTables()
    320                      
    321563        return True
    322564
    323565
    324                
    325 
    326 
    327 
    328 
    329 
    330 
    331566    def generateRandomIDs(self):
    332            sql = "UPDATE ForcedWarpMeasurement set randomWarpID = FLOOR(RAND("+str(self.batchID)+")*9223372036854775807)"
    333         try: self.scratchDb.execute(sql)
     567        sql = "UPDATE ForcedWarpMeasurement set randomWarpID = FLOOR(RAND("+str(self.batchID)+")*9223372036854775807)"
     568        try:
     569            self.scratchDb.execute(sql)
    334570        except:
    335571            self.logger.errorPair('failed sql',sql)
    336             return
     572            raise
    337573
    338574
    … …  
    341577    '''
    342578
    343     def generatePspsUniqueIDs(self):
    344         sql = "UPDATE ForcedWarpMeasurement join (select @r:=@r+1 rownum, objID from \
    345         (select @r:=0) r, ForcedWarpMeasurement t) as foo using (objID) set \
    346         uniquePspsFWid = ((" +str(self.batchID)+ "*1000000000 ) + rownum)"
     579    def generateUniquePspsIDs(self):
     580        sql = "UPDATE ForcedWarpMeasurement set uniquePspsFWid = (("+str(self.batchID)+"*1000000000 ) + row)"
    347581        try: self.scratchDb.execute(sql)
    348582        except:
    349583           self.logger.errorPair('failed sql',sql)
    350            return
    351            
    352 
    353 
    354 
    355 
    356 
     584           raise
     585
     586    '''
     587    Defines the tables to be exported to psps           
     588    '''
    357589
    358590    def exportPspsTablesToFits(self, regex="(.*)"):
    359        return super(DetectionBatch, self).exportPspsTablesToFits("(ForcedWarp.*)")
     591       return super(ForcedWarpBatch, self).exportPspsTablesToFits("(ForcedWarp.*)")
     592
     593
     594    '''
     595    Drop a table and report the drop
     596    '''
     597    def dropTableVerbose(self, table):
     598        self.logger.infoPair("dropping table:",table)
     599        self.scratchDb.dropTable(table)
     600
     601
     602    '''
     603    Applies indexes to the PSPS tables
     604    '''
     605    def alterPspsTables(self):
     606
     607        self.logger.debug("Altering PSPS tables (currently does nothing in stackbatch)")
     608
     609        return True
     610
     611    '''
     612    Applies indexes to the IPP tables
     613    '''
     614    def indexIppTables(self):
     615
     616        self.logger.infoPair("Creating indexes on", "IPP tables")
     617        self.scratchDb.createIndex("SkyChip_psf",  "IPP_IDET")
     618        self.scratchDb.createIndex("SkyChip_xfit", "IPP_IDET")
     619        self.scratchDb.createIndex("SkyChip_xrad", "IPP_IDET")
     620        self.scratchDb.createIndex("SkyChip_xsrc", "IPP_IDET")
     621        self.scratchDb.createIndex("SkyChip_xgal", "IPP_IDET")
     622
     623        return True
     624
     625    '''
     626    Updates table and generates pspsuniqueids
     627    '''
     628
     629    def updatePspsUniqueIDs(self,table):
     630        sql = "UPDATE ForcedWarpMeasurement set uniquePspsFWid = (("+str(self.batchID)+"*1000000000 ) + row)"
     631        try: self.scratchDb.execute(sql)
     632        except:
     633            self.logger.errorPair('failed sql',sql)
     634            raise
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.